蛇毒較大的價值就是用于醫學。大量的臨床實踐證明，蛇毒有以下的臨床應用。 

　　第一蛇毒有鎮痛作用，廣州醫學院研制的眼鏡蛇毒注射液用于臨床，對三叉神經痛、坐骨神經痛、惡性腫瘤痛、風濕與類風濕關節痛、偏頭痛、帶狀皰疹等以疼痛為主要癥狀的疾病具有良好的作用。蛇毒作為鎮痛劑有如下優點：作用顯著且持久、安全范圍寬、連續用藥無耐藥性，不像嗎啡那樣有成隱的感覺和危險。昆明動物研究所于1976年從眼鏡蛇毒中試制成功的克痛靈，對治療各種疼痛性疾病有很好的療效。降低血壓，從巴西矛頭蝮蛇毒分離得到一種活性肽，能阻斷血管緊張素的轉化，從而降低人體血管緊張素的增壓活性，可用于防治腎性高血壓及長時間壓迫腎動脈所致的血壓升高。我國也已發現五步蛇毒中有降壓活性非常明顯的組分，可開發成一種新的降壓藥。止血作用，蝰蛇毒可使血液中的纖維蛋白原變成纖維蛋白而形成凝血塊，可用0.1%蝰蛇毒的滅菌溶液治療血友病等的出血。此外，還可以用于血液病的鑒別診斷，成為臨床檢驗方法之一。

第二治療腦血栓及脈管炎解放軍238醫院利用長白山白眉蝮蛇毒，經高溫度純化，得到類凝血酶，醫藥名叫“清栓酶”，不含任何有毒成分，治療腦血栓及其后遺癥。臨床證明，該酶安全可靠，療效很好。對脈管炎病人能使疼痛迅速緩解，并促進食欲和睡眠的作用。有部分腦血栓偏癱病人還從此得到了康復。治療胃、十二指腸潰瘍　 中國醫科大學研究室用毒蛇治療胃、十二指腸潰瘍6例，經鋇餐及胃鏡復查，僅用藥30天，5例完全治愈，1例潰瘍縮小。臨床還證明，應用蛇毒治療消化道潰瘍，具有止痛和促進睡眠的作用，并有增加患者食欲和體重的優點，很值得推廣使用。

第三制備抗蛇毒血清我國從20世紀30年代起開始制抗蛇毒血清，先后研究成功了精制抗蝮蛇、五步蛇、銀環蛇、眼鏡蛇、新疆蝮蛇、海蛇、金環蛇、蝰蛇等毒蛇的抗蛇毒血清，為救治被毒蛇咬傷的人們立下了汗馬功勞。 蛇毒還用在戒毒和軍事領域 　美國的研究機構已從事這方面的研究。
所以蛇毒的作用是很大的。