為了確保蛇毒的利用價值，其質量的優劣至為重要。因此，必須妥善地處理好有關環節，判斷蛇毒的質量要求了解蛇毒制備的全過程，并根據其色澤是否純正，質地是否松脆，或是顆粒的大小和形狀等方面初步判斷蛇毒的質量優劣。通常判斷蛇毒質量須用5個項目，必要時要加一個酶的指標，衡量蛇毒質量要各個項目和指標內在聯系，且相互關聯反映該蛇毒質量。
(1)電泳各種蛇毒的成分是不同的，在將蛇毒置于聚丙烯酰胺凝膠上時，由于其各組分帶電情況不同，它們在電場中的泳動情況亦異，從而各種蛇毒就會顯示出自己特殊的電泳區帶。據此測可判定真偽或有無混人別的蛇毒。 (2)生物毒力 即小鼠半數致死量(LD。。)。它是將蛇毒配成一定的濃度，注入體重約20克的小鼠體內，能引起50％的小鼠在1天內死亡的干毒量。其單位為毫克／千克。分子中的單位毫克是指干蛇毒用量，分母中的千克是指小鼠體重，均經計算后得出。此值越小表示該種蛇毒的毒力越強。但蛇毒進入小鼠體內的途徑不同。值也不同。
(3)蛋白質的含量 蛇毒中蛋白質含量達90％左右，因此測定蛇毒中所含蛋白質的百分率即可，百分率愈高品質愈佳。
(4)測定溶解度 以非溶性物質表示，其值越小，品質越好，一般以O．5％為宜。
(5)蛇毒中的含水量蛇毒雖已經干燥，但在正常情況下仍含有一定量的水分。測定毒液中的含水量是以解毒液重量作分母，以解毒液重減去干毒重的差為分子，得出的百分數。若含水量高，說明蛇毒重量有虛假數值。一般規定，含水量不宜高于5％，以1 9／6～3％為佳。
(6)酶活力 酶是生物催化劑。由于大多數酶較敏感，制備蛇毒過程中極易喪失活力。故有時要求測定蛇毒中含有的酶及其活力大小。酶的種類甚多，一般以單位重量的蛇毒中，某一酶具有的活力單位來表示。
衡量蛇毒質量的各項指標都有內在聯系，所以在鑒別蛇毒質量時首先要看電泳一項，確定它是否為該種蛇毒，在此前提下，若LD。。小，即毒力強，說明該毒質量好。而要LDso小一般總以蛋白質含量高、溶解性好、含水量低為綜合指標，否則，難以顯示其強的毒力。若蛇毒中含水量高，則易使其變質，導致溶解度差、LD。。大、蛋白質濃度低等。此外，蛇毒制備過程中要求精心操作，不能把不同種的蛇毒相混，蛇毒中也不能混有膿液、黏液、微生物、血液和泥沙等。外觀上即使未能明顯看出，但其質量指標必然有所反映。蛇毒在進入市場前，均需進行以上鑒定，然后定價銷售。
